Au beau milieu du ciel, Volcanion, un Pokémon utilisant la vapeur pour se déplacer dans les airs, atterrit sur un vaisseau. Il désire libérer le Pokémon Magearna, capturé par Alva et ses hommes originaires du Royaume d'Azoth, une cité mécanisée où a été développée l’Onde Méga qui permet de faire méga-évoluer les Pokémon sans l'aide de gemme sésame et de méga-gemme. Mais Volcanion échoue et se retrouve projeté hors du vaisseau avec une étrange ceinture lancée par l'un des hommes d’Alva.

Note: La date de sortie française du film est en réalité la date de sa première diffusion à la télévision. Le film n'a en effet pas encore bénéficié d'une sortie DVD sur notre territoire.