Yukimura Chizuru, une jeune femme venue d'Edo voyage pour Kyoto à la recherche de son père disparu. À son arrivée dans la capitale, des rond la prennent en chasse dès la nuit tombée. Cachée dans une ruelle, elle voit ses assaillants se faire pourfendre par des monstres et finit par s'évanouir. À son réveil, Chizuru est ligotée dans les quartiers du Shinsengumi dont les membres débattent sur les mesures à prendre afin de la faire taire. Alors que son sort semble prendre une mauvaise tournure, elle apprend que la milice est également à la recherche de son père et se propose de les aider.