Momo, une petite fille, vit une vie paisible avec ses amis. Mais lorsque d'étranges hommes en gris arrivent en ville et proposent aux habitants de placer leur temps en épargne à la Banque du Temps pour l'utiliser plus tard, une étrange frénésie s'empare de la cité, obsédée par l'idée de ne plus gaspiller la moindre seconde. Pour déjouer les plans des Hommes en gris, qui utilisent le temps des habitants sans jamais le leur rendre, Momo doit partir à la recherche du professeur Secundus Minutus Hora et de la tortue Cassiopée.